危害檔案室、庫房、機房等場景的嚙齒動物主要是鼠類，由于檔案庫房等場所較為封閉、安靜，也容易成為鳥類、蝙蝠、爬行動物的棲息場所，并且鼠類食性復雜，善于掘洞噴咬，繁殖能力高，適應能力強，對檔案室、庫房等危害，主要表現有以下方面：

對庫房、機房等建筑物與構筑物的破壞較大，鼠穴、鼠道不僅會使雨水、雪水沿其滲入機構基礎，侵蝕基礎，損壞庫房構筑物，影響庫房的使用年限，而且還會破壞墻體、屋頂的空氣間層結構和地面的防水、防潮結構，降低庫房的隔熱、防潮與密閉性能，加重灰塵及有害氣體對現場的污染和蟲霉對檔案的危害，并給庫內溫濕度的調控造成困難。

對檔案室、庫房等設備及裝具的破壞，老鼠的牙齒十分堅硬銳利，可以經常啃咬硬物。在鼠害嚴重的庫房存在金屬裝具被啃掉面漆、啃出溝痕甚至啃穿成洞，木質裝具被啃去邊角，咬斷立柱、紙質裝具被成片啃毀等現象。

對檔案的破壞，老鼠對檔案的破壞是毀滅性的，當老鼠通過鼠洞、門窗、墻壁、天棚縫隙或人為夾帶等途徑進人庫房后，一旦突破檔案裝具的防線，就會將檔案作為攻擊對象。它們可以將檔案紙張撕成碎片，啃成孔洞，甚至全部咬成紙屑。有的老鼠還將紙張拖人鼠洞做窩，直接在檔案柜、檔案箱內筑巢、棲息和繁殖，進一步擴大危害程度和范圍。對被老鼠破壞的檔案，特別是對已成碎屑或撕成碎片等破壞面積較大、程度較嚴重的檔案進行修復是十分困難的，有些檔案甚至無法修復，造成無法彌補的損失。

對檔案及庫房環境的污染。老鼠在檔案庫房中棲息、活動和啃咬檔案的過程中，由于經常排泄分泌物，從而造成檔案和庫房內環境的污染，而且老鼠是多種自然疫原性疾病的宿主，因此，鼠體及其污染物會將多種病原菌、霉菌、螨類以及跳蚤、壁虱等寄生蟲傳播給檔案管理者和利用者，危害人們的健康。此外，檔案裝具及檔案紙張被老鼠啃咬下的碎屑、碎片以及鼠體的粘附物、排泄物等，還會隨空氣的流動和老鼠的活動飄散在整個庫房空間，造成庫房環境的污染。